1683年，清軍以澎湖為根據地，即將大舉攻台，聽到鄭克塽準備投降的消息，明寧靖王不願受辱，招來5名妃子，告知以身殉國的決定，妃子聽了之後放聲痛哭，並齊聲說，「殿下為了保節寧願犧牲性命，我們豈有苟活的道理？」，說完後，5人從容就義，自縊身亡；在歷史的轉折處，巾幗不讓鬚眉，以身殉國的悲壯抉擇，這就是五妃廟背後的故事。

五妃廟葬著的是袁氏、王氏、秀姑、梅姐、荷姐，5名寧靖王的姬妾，她們合葬的地方，原稱為「魁斗山」，此地曾是一處亂葬崗，五妃的墓也十分簡單，直到清乾隆11年(1746)，這個歷史悲劇發生超過半世紀後，巡台御史為收服人心，命海防同知方邦基在墓前建廟，五妃墓才比較有規模。

五妃廟是一座墓廟合一的陰廟，前面是廟，廟的後面連著墓塚，日據時代曾經大修，也奠定今天的規模，民國66年也曾經整修，最近一次的整修時間則在民國86年時，也因為歷經多次整修，五妃廟雖被列為1級古蹟，但廟體看起來並不老舊。
五妃廟的區域空間相當寬闊，樹木環繞，環境十分清幽，堆滿樹瘤的老金龜樹，是時間的見證；其廟體並不大，小小的正殿，許多鄉野的土地公廟，都有這樣的規模，比較特別的是，如此小巧的正殿前還做出一個拜亭，整座廟呈兩進排列，左右也有護龍，以做出其氣勢。

五妃廟內主祀五妃，左右兩側則有灶神及土地公陪祀，由於祭祀的對象為女性，祭品也比較特別，像明星花露水、鏡子等用品，是一般廟宇中看不到的祭品。

神龕正後方就是墓碑，刻著「寧靖王從死五妃墓」的碑石直接嵌在廟體牆面上，而這片牆的後方就是墓塚。
走出五妃廟，轉向後方，就可以清楚看到整個墓塚。
五妃廟旁還有一座簡單的小廟，為義靈君祠；義、靈是寧靖王的侍官，寧靖王投環自縊時，兩名侍官也從主殉國，只是後人將寧靖王遺體移到高雄縣湖內鄉與元配羅妃合葬，而義、靈兩從官則葬在五妃墓塚旁。

走訪台南古城，看到的是荷蘭人、明鄭、日本人交織的治理痕跡，漸漸理出一道道歷史的脈絡；寧靖王殉國是明朝的句點，也是少數只提明朝，不提鄭成功的歷史記憶。
文建會歷史建築經典「古都文化」之旅，可參考網站訊息http://hbtravel.cca.gov.tw/