現代醫學日新月異，雷射在醫療上的應用也愈來愈廣泛，眼睛本身就是一種光學系統，將不同波長的雷射能量，經過精密儀器的導引，可以到達眼睛內各個組織，而治療特定的疾病，所以雷射在眼科應用的範圍日漸廣泛，而且能達到不錯的治療效果。

在眼科門診中，常用的雷射包括氬氣或二極體雷射，可治療糖尿病視網膜病變，降低糖尿病患者失明的機率；視網膜裂孔或變薄，可以使用雷射光凝固的效果，將裂孔封住或補強，以避免視網膜剝離的發生；高血壓、高血脂、或動脈硬化造成的視網膜動脈或靜脈阻塞，在視網膜血液循環不良的情形下，可利用雷射預防不正常的新生血管生成，降低引發青光眼及失明的危險。


準分子雷射是利用雷射光在眼角膜上作組織切除，來達到角膜組織氣化切除的目的，可治療近視、散光等屈光不正，或其他角膜病變。

近年發展的經瞳孔雷射熱療法，是用特殊波長的紅外線，穿透正常網膜，來照射脈絡膜新生血管；不僅可直接治療脈絡膜新生血管，同時可以減少對網膜正常組織的破壞。

光動力療法，是先在病患靜脈內注射光敏感藥劑，再用雷射照射病灶，是一種高選擇性的治療。以上兩種對黃斑部脈絡膜新生血管的治療，大多可達到視力穩定或進步的效果。

白內障的治療，目前仍然需要用手術，包括傳統手術及超音波乳化術，即使白內障的雷射治療，已經有所進步，但尚未普遍應用於病患。

一般而言，雷射治療的位置如果在角膜，眼睛表面則會有傷口，大多在一週內可癒合；若傷口在眼球內部，如視網膜裂孔的雷射光凝治療，則外表是沒有傷口的，但需要兩週時間才能完全痊癒。