在公司win2003和win2000server並存大約有一年多了,經驗中win2003穩定很多,各種service執行效能約為win2000的1.2~1.4倍(同一硬體等級Xeon2.8G*2,2GRAM),且許多安全議題也都比win2000好(但有時太注重安全反而綁手綁腳).
另外win2003 Termimal Server可支援全彩及硬碟對應(win2000只支援至256色且硬碟對應需外掛Third Party軟體),且Termainal License再per user下有Bug,好像可無限期使用(若無授權應只有120天試用,不過微軟好像將於下個SP解決此問題),但2003Terminal遠端登入不支援大字型為美中不足處.其他有關遠端存取如VPN等也比Win2000好且穩定.
程式方面,因2003全面支援.NET,故網頁若為.NET效能將2000好很多,但若為傳統ASP程式則2000好很多了.
Client支援方面,win95似乎無法登入win2003網域,win98,ME,2000Pro對2003及2000server沒差,但XP較適合win2003.
總歸,若安全上已有其他方案,且暫時不擁抱.NET,或遠端登入不要求256色以上,應仍可採Win2000 Server,要不然個人強烈建議採用Win2003 Server.
以上純為個人經驗及看法,歡迎指教